La Multistrada 1200S è disponibile in tre configurazioni: Sport Editon, Touring Edition e Pikes Peak Special Edition.

La Sport Edition è pensata per chi vuole accentuare il carattere sportivo e distintivo della Multistrada 1200 grazie ad alcuni particolari in fibra di carbonio (prese d'aria anteriori, cartelle motore, estrattori aria e parafango posteriore) che elevano ulteriormente il livello della componentistica.

La Touring Edition è ideale per chi vuole viaggiare con il massimo comfort e stile grazie alle capienti valigie laterali, al cavalletto centrale e alle manopole riscaldate.

La Pikes Peak Special Edition è la replica della moto da gara che ha vinto, nel 2010, la Pikes Peak International Hill Climb race dando prova della sua incredibile versatilità su tutti i terreni e dimostrando come anche la Multistrada possieda il DNA sportivo proprio di tutti i modelli Ducati. La Pikes Peak Special Edition incarna proprio lo spirito racing della Multistrada ed è pensata per tutti coloro che amano esibire la propria sportività: livrea Ducati Corse, cupolino in carbonio e scarico Ducati Performance a corredo (omologato solo per i Paesi UE).
A tutto questo si aggiungongono anche l'innovativo sistema DES (Ducati Electronic Suspension) di regolazione elettronica delle sospensioni Ohlins e il sistema ABS, entrambi di serie.